28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2323 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  547  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  74.37 
 
 
303 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  56.58 
 
 
314 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  52.69 
 
 
292 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  47.87 
 
 
288 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  49.64 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  53.38 
 
 
299 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  48.19 
 
 
327 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  51.96 
 
 
299 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  50.35 
 
 
296 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  45.29 
 
 
316 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  32.22 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  30.14 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  30.11 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  32.82 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.12 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  33.07 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  26.92 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  24.88 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  31.13 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  30.09 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  31.22 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  30.13 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  28.72 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.24 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0642  multi- copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component-like protein  27.73 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>