31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3426 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  49.06 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  45.91 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  42.91 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  44.53 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  45.15 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  49.3 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  45.71 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  39.15 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  39.62 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  33.84 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  37.79 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  33.72 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  33.84 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  31.71 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  29.45 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  32.81 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  32.58 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  32.82 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  33.2 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  33.62 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  30.15 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  28.97 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  22.69 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  35.51 
 
 		 457 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  33.04 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  33.06 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  19.9 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  21.72 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>