80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2944 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  100 
 
 		 736 aa  1506    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 768 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  41.96 
 
 		 748 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  39.2 
 
 		 767 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27.16 
 
 		 972 aa  95.5  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.05 
 
 		 251 aa  93.2  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  33.46 
 
 		 248 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  30.83 
 
 		 998 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.85 
 
 		 977 aa  84  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 234 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  29.68 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.77 
 
 		 964 aa  81.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.9 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  30.05 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  23.16 
 
 		 462 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26.27 
 
 		 244 aa  73.6  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  24.25 
 
 		 603 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  24.25 
 
 		 603 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.74 
 
 		 244 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.91 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 256 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  23.96 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  28.23 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  28.46 
 
 		 244 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  22.77 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.13 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  22.99 
 
 		 703 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  25.3 
 
 		 242 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  28.85 
 
 		 241 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  24.61 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  27.91 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  22.63 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  21.66 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  31.41 
 
 		 235 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  27.35 
 
 		 240 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  25.65 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  33.75 
 
 		 250 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  27.63 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  27.03 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  27.8 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  20.93 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 244 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  24.8 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  27.45 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  27.08 
 
 		 240 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  25.22 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 260 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  34.68 
 
 		 269 aa  54.7  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  25.38 
 
 		 244 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  20.64 
 
 		 517 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  33.02 
 
 		 891 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  23.49 
 
 		 504 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  26.46 
 
 		 248 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  25.27 
 
 		 770 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 244 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 242 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.6 
 
 		 247 aa  51.2  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 235 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.69 
 
 		 270 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 242 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 267 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  35.14 
 
 		 326 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 266 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 261 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.77 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 261 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 368 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  34.29 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  29.02 
 
 		 239 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  32.61 
 
 		 942 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  29.5 
 
 		 906 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  26.67 
 
 		 918 aa  44.3  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 		 378 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>