34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1721 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  94.68 
 
 
263 aa  497  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  34.46 
 
 
266 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.09 
 
 
265 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.55 
 
 
266 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  30.09 
 
 
264 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  25.56 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  24.72 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  23.88 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  22.64 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  25.94 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  22.26 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  23.64 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  23.73 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  24.54 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  27.19 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  23.73 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  24 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  25.75 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  24.79 
 
 
277 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  22 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  24 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.17 
 
 
248 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  22.17 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  27.27 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  22.59 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  33.7 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
242 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  30.57 
 
 
357 aa  42  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  25 
 
 
242 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>