20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4578 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  100 
 
 		 270 aa  541  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  33.83 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  34.87 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  32.58 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.73 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2772  putative ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  27.43 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  24.25 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  27.11 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.14 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  25.18 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  27.19 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  22.83 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  20.63 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  22.81 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  21.49 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>