25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2170 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
268 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  30 
 
 
268 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  29.63 
 
 
268 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
268 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
268 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  30.74 
 
 
268 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  29.1 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3617  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
163 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1989  hypothetical protein  28.95 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000959722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3619  ABC transporter, permease  26.61 
 
 
118 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  27.69 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.48 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  22.93 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  20.51 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  22.3 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  23.9 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  34.09 
 
 
736 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  23.81 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3387  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0679689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  22.59 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  20.36 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>