36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0090 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  32.43 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  33.71 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  31.37 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  33.97 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.38 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  24.11 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.43 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  34.05 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  22.78 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  22.01 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  21.92 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  26.56 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  27.76 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  31.75 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  24 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  22.73 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  32.87 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  24.9 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  25.6 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  23.2 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  17.65 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  27.04 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  31.71 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  44.64 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.2 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.24 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  39.06 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  41.27 
 
 		 398 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  35.82 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>