29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1185 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  517  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  32.45 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  32.82 
 
 
265 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.01 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  22.64 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  25.09 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  22.26 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.22 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  24.91 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  21.11 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  17.74 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  21.17 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1476  ABC transporter, permease protein, putative  30.14 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  20.52 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1449  putative ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0130879 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  22.97 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1377  ABC transporter permease  26.36 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0512009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1275  ABC transporter permease  26.36 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00493977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1247  bacitracin ABC transporter, permease  28.77 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00130672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  20.52 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1249  bacitracin ABC transporter, permease  28.77 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0635173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  19.86 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1518  putative ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1282  ABC transporter, permease protein, putative  31.51 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  20.56 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  20 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  20.56 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  20 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  20 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>