33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4246 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  513  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  39.47 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  36.43 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  36.76 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  34.72 
 
 
262 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.28 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  25.1 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  20.24 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  20.65 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  32.56 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  24.81 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  19.67 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  19.67 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  18.83 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  23.05 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  18.41 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  29.15 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  22.55 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  21.05 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  26.34 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.98 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1989  hypothetical protein  23.56 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000959722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  18.87 
 
 
208 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  36.63 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  24.31 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.11 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 
375 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  23.93 
 
 
546 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>