62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0683 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
248 aa  487  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  43.2 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  46.12 
 
 
244 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  45.02 
 
 
254 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.07 
 
 
256 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  34.94 
 
 
250 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  31.47 
 
 
241 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  30.38 
 
 
244 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  33.46 
 
 
736 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  31.23 
 
 
244 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  31.08 
 
 
244 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 
768 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  30.68 
 
 
244 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  28 
 
 
287 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  28.68 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  29.37 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.27 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.04 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  32.03 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  29.12 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  29.53 
 
 
964 aa  88.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.01 
 
 
748 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  31.62 
 
 
998 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  30.08 
 
 
972 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.15 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  29.74 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  29.07 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.73 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.51 
 
 
977 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  29.76 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.81 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  25.2 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.89 
 
 
767 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
247 aa  72  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  27.32 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.95 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  28.06 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  29.12 
 
 
770 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  30.73 
 
 
891 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  28.17 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  28.67 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  32.26 
 
 
257 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  34.4 
 
 
369 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>