85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2722 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  55 
 
 
242 aa  284  9e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  47.08 
 
 
240 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  46.75 
 
 
242 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  46.28 
 
 
242 aa  205  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  48.13 
 
 
244 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  47.08 
 
 
239 aa  198  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  46.44 
 
 
240 aa  187  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  44.21 
 
 
242 aa  184  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  38.79 
 
 
244 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
244 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  37.34 
 
 
244 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.66 
 
 
244 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  36.93 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  37.29 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  35.98 
 
 
964 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  38.56 
 
 
972 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  35.92 
 
 
244 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  36.51 
 
 
244 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.66 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
247 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  33.47 
 
 
977 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  35.42 
 
 
998 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.42 
 
 
256 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  36.12 
 
 
234 aa  118  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.62 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  31.54 
 
 
244 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
260 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  27.06 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  30.41 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  29.41 
 
 
235 aa  89  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 
261 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  26.15 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  23.43 
 
 
770 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.41 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  30.17 
 
 
891 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  32.8 
 
 
748 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.93 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
768 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.29 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.94 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.85 
 
 
736 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.95 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  26.97 
 
 
269 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  22.98 
 
 
767 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 
381 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  33.13 
 
 
289 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  28.99 
 
 
366 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  27.1 
 
 
1106 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.17 
 
 
382 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  28.4 
 
 
366 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.9 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  34.72 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.09 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.85 
 
 
384 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 
384 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  30.43 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  26.71 
 
 
373 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
366 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  29.8 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 
367 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
377 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
384 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.68 
 
 
375 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>