65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0296 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  47.92 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  46.09 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  37.28 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  39.91 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.2 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  28.76 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  32.39 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27 
 
 		 972 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  29.79 
 
 		 977 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.69 
 
 		 964 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  30.96 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  31.6 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  30.83 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  26.51 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  32.3 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  30.54 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.12 
 
 		 244 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  30.8 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  28.75 
 
 		 998 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  29.8 
 
 		 891 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  30.04 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  35.36 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  29.27 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29 
 
 		 270 aa  88.6  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  26.64 
 
 		 770 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  25.42 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.08 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  29.63 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29.8 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.43 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.67 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  32.04 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.8 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  26.17 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.15 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 768 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.15 
 
 		 748 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  24.79 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  24.81 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.99 
 
 		 767 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  24.67 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  28.02 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  25 
 
 		 918 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  24.82 
 
 		 927 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  22.39 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.97 
 
 		 907 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  26.67 
 
 		 1106 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>