60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6080 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 242 aa  470  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.19 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  35.41 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  27.27 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  34.63 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  34.82 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.04 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  34.51 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  28.18 
 
 		 287 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.17 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  33.2 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  32.64 
 
 		 770 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.64 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  30.45 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.71 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26.25 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.16 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.32 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.57 
 
 		 977 aa  68.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  25.9 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  34.68 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  25.91 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  30.2 
 
 		 964 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  30.22 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  28.75 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  31.71 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  29.72 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  30 
 
 		 972 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  36.43 
 
 		 891 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  31.62 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  29.5 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 		 768 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  33.33 
 
 		 998 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  37.69 
 
 		 748 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  38.71 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.2 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  32.97 
 
 		 736 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  30.73 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.48 
 
 		 767 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>