63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4231 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 270 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  79.26 
 
 		 270 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  62.59 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  61.39 
 
 		 266 aa  305  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  60.45 
 
 		 260 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  54.85 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  54.85 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  51.15 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.59 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.55 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  31.72 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.32 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  26.97 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  24.62 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  30 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  29.62 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  26.59 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  27.24 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28.73 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.98 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  30.57 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  27.86 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 768 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  28.52 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.67 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  27.42 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.04 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  28.71 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.06 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.27 
 
 		 770 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  35.2 
 
 		 891 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  31.61 
 
 		 977 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.92 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.2 
 
 		 964 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  26.87 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  29.01 
 
 		 736 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  25.82 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.22 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  27.13 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  25.95 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  23.5 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.49 
 
 		 748 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  27.17 
 
 		 972 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  24.62 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  27.27 
 
 		 998 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  31.45 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  30.4 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.63 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>