95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2141 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  41.46 
 
 		 998 aa  688    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  55.99 
 
 		 964 aa  1038    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  100 
 
 		 972 aa  1961    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  53.56 
 
 		 977 aa  1041    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 		 244 aa  161  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  38.2 
 
 		 244 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  41.52 
 
 		 244 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  38.63 
 
 		 244 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  38.3 
 
 		 244 aa  157  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  37.66 
 
 		 244 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  39.56 
 
 		 243 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  39.83 
 
 		 244 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 256 aa  154  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  38.56 
 
 		 241 aa  154  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  38.05 
 
 		 244 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  28.34 
 
 		 891 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.36 
 
 		 247 aa  141  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 242 aa  135  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  31.22 
 
 		 244 aa  132  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 		 242 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  34.16 
 
 		 242 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 247 aa  127  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  37.28 
 
 		 240 aa  125  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  40.81 
 
 		 240 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 		 234 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 234 aa  109  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.21 
 
 		 248 aa  108  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 235 aa  106  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 235 aa  105  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.23 
 
 		 256 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  27.97 
 
 		 287 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  27.16 
 
 		 736 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  27.69 
 
 		 235 aa  102  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  36.94 
 
 		 235 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2608  ABC-type uncharacterized transport system  20.97 
 
 		 678 aa  99.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00018467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  36.63 
 
 		 242 aa  97.8  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  23.62 
 
 		 508 aa  95.9  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.71 
 
 		 240 aa  94.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.64 
 
 		 248 aa  94  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  26.52 
 
 		 729 aa  91.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 768 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.46 
 
 		 748 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  32.92 
 
 		 239 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  36.32 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29.39 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.44 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.7 
 
 		 260 aa  73.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  27.46 
 
 		 770 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 242 aa  72  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.63 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 261 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  23.98 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  21.32 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  21.96 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  21.9 
 
 		 615 aa  62  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.93 
 
 		 610 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  23.86 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  35.65 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08361  GldG  21.52 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  27.2 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  26.03 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  26.92 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 610 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 266 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2112  hypothetical protein  27.47 
 
 		 495 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  26.71 
 
 		 600 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 313 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0779  hypothetical protein  22.07 
 
 		 502 aa  54.7  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 267 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  33.66 
 
 		 622 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  23.75 
 
 		 600 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  27.51 
 
 		 550 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  32.14 
 
 		 918 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  29.78 
 
 		 901 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  48.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2907  hypothetical protein  35.42 
 
 		 614 aa  48.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  27.2 
 
 		 498 aa  48.1  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 378 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  30.28 
 
 		 481 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  46.2  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 372 aa  46.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 366 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 384 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.32 
 
 		 916 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  38.27 
 
 		 450 aa  45.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 384 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 		 523 aa  45.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 387 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  35.09 
 
 		 384 aa  44.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.38 
 
 		 384 aa  44.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>