25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1722 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  46.49 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  42.78 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  37.55 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  32.87 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  33.62 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  34.72 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  27.76 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  32.55 
 
 		 363 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  32.4 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  30.27 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  32.49 
 
 		 377 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  32.95 
 
 		 385 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.71 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  29.31 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  26.6 
 
 		 370 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0551  hypothetical protein  32.8 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0231  hypothetical protein  28.4 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  29.94 
 
 		 972 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  30.82 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>