22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3060 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  79.24 
 
 
313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  47.74 
 
 
289 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  31.42 
 
 
334 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  39.46 
 
 
357 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  35.24 
 
 
291 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  34.54 
 
 
283 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  33.73 
 
 
309 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  43.62 
 
 
363 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  28.7 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  30.51 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  27.92 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.53 
 
 
416 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  27.67 
 
 
378 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  29.57 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  29.89 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  27.03 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.04 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  27.64 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26.05 
 
 
244 aa  42.4  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>