21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0428 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  35.1 
 
 
357 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  40.21 
 
 
313 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  43.46 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  35.06 
 
 
309 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  36.02 
 
 
334 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  32.71 
 
 
283 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  30.13 
 
 
278 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  32.62 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  30 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  29.65 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.15 
 
 
416 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 
283 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  26.26 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  25.28 
 
 
378 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3249  hypothetical protein  29.41 
 
 
578 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.277826  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
242 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  45.28 
 
 
243 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>