26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3514 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  38.3 
 
 
278 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  32.15 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  36.05 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  30.51 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  36.51 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  30.3 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  31.55 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  30.88 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  29.63 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  31.38 
 
 
385 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  29.03 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  33.59 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.85 
 
 
416 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  27.32 
 
 
378 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  31.72 
 
 
964 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  29.93 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3014  hypothetical protein  30.7 
 
 
561 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  32.8 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
243 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>