22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2418 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  77.33 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  48.1 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  29.88 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  39.01 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  37.72 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  29.89 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  29.44 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  31.96 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  39.89 
 
 		 363 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  31.32 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.48 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  29.29 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  28.3 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  26.7 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  26.49 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  28.48 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  30.49 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  30.49 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.04 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>