20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0275 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  749    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  48.19 
 
 
373 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0551  hypothetical protein  55.25 
 
 
363 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  42.97 
 
 
378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  34.54 
 
 
370 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  37.09 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  39.4 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02630  hypothetical protein  32.68 
 
 
418 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  29.29 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  28.38 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  32.53 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  31.38 
 
 
304 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  26.7 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  29.83 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  31.75 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  29.89 
 
 
301 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  27.37 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  22.4 
 
 
280 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>