19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0551 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0551  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  697    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  55.65 
 
 
385 aa  299  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  50.98 
 
 
373 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  39.18 
 
 
378 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  35.53 
 
 
370 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  44.29 
 
 
377 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  35.12 
 
 
416 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02630  hypothetical protein  35.52 
 
 
418 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  29.57 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  32.16 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  29.5 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  26.29 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  27.8 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
289 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  27.61 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  24.12 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  27.32 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  31.47 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  27.32 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>