24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1357 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  53.9 
 
 
278 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  47.31 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  41 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
289 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  29.44 
 
 
313 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  32.15 
 
 
304 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  34.54 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  34.5 
 
 
357 aa  95.5  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  26.76 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  28.42 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  32.68 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3122  hypothetical protein  28.65 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0178117  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  28.38 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  30.73 
 
 
370 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  36.8 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  26.19 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  28.12 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0551  hypothetical protein  30.43 
 
 
363 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  27.35 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.32 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.76 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>