63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4024 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  58.11 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  58.11 
 
 
261 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  62.59 
 
 
270 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  58.11 
 
 
261 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  59.85 
 
 
270 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  57.14 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  50.39 
 
 
269 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.59 
 
 
256 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.76 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
234 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 
235 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.21 
 
 
251 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  29.3 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.47 
 
 
235 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  31.42 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  26.86 
 
 
287 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 
242 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  29.62 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  25.83 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  28.03 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  29.39 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.96 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.47 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  30.53 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.61 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.03 
 
 
770 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  33.46 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  29.84 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  31.35 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.59 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
768 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.05 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  24.22 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.57 
 
 
964 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.78 
 
 
748 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.95 
 
 
767 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  28.46 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  28.81 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  26.59 
 
 
972 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  30.23 
 
 
891 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.06 
 
 
736 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  29.03 
 
 
977 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  23.41 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  25.87 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  24.56 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  34.07 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  28.04 
 
 
998 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
387 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 
388 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
381 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>