84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5656 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  100 
 
 		 770 aa  1469    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 768 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 235 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 235 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.64 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  25.52 
 
 		 517 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  23.85 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 		 242 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.22 
 
 		 240 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  31 
 
 		 260 aa  104  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  29.2 
 
 		 235 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  30.12 
 
 		 253 aa  98.2  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 242 aa  97.4  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  35.91 
 
 		 287 aa  97.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  20.56 
 
 		 542 aa  95.1  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  23.43 
 
 		 241 aa  94.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  23.14 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 234 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 247 aa  90.5  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  20.76 
 
 		 462 aa  90.1  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 260 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.03 
 
 		 242 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  26.98 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.28 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  32.45 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  30.61 
 
 		 977 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  32.44 
 
 		 244 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  25.58 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  25.58 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.96 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  28.43 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  22.22 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  31.8 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  25.21 
 
 		 240 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  23.13 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  31.09 
 
 		 244 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  24.19 
 
 		 244 aa  80.1  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  31.5 
 
 		 270 aa  80.1  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  30.71 
 
 		 243 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  31.06 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  22.78 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  27.6 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 244 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  27.57 
 
 		 891 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 244 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  20.83 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  28.75 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  31.03 
 
 		 240 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  23.89 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  23.35 
 
 		 703 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  22.8 
 
 		 748 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  21.82 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  18.84 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.85 
 
 		 248 aa  67.4  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  29.8 
 
 		 964 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  25.61 
 
 		 972 aa  66.6  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.19 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  23.5 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  21.81 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  29.7 
 
 		 250 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0089  hypothetical protein  26.28 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  26.42 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  23.84 
 
 		 473 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.26 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  27.41 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.27 
 
 		 270 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  28.33 
 
 		 242 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  26.54 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  22.91 
 
 		 557 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 388 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 387 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  32.42 
 
 		 269 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 384 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 384 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 384 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>