72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1018 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  99.23 
 
 		 261 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  66.28 
 
 		 260 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  58.11 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  50.98 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  51.12 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  54.85 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  46.67 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.63 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  25.28 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.49 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  28.39 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  34.17 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  27.23 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  27.13 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  27.13 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.12 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  26.52 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.26 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  26.59 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  28.46 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28.52 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  28 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  27.91 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.09 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  26.83 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  26.69 
 
 		 770 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.19 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  27.95 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 768 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  23.94 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.56 
 
 		 964 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  29.2 
 
 		 891 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  25.71 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  25.94 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.31 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  26.82 
 
 		 972 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  34.13 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.09 
 
 		 767 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.86 
 
 		 748 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  27.81 
 
 		 977 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  26.13 
 
 		 911 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  21.05 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  27.41 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  24.49 
 
 		 736 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  28.78 
 
 		 366 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 381 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  26.11 
 
 		 994 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  28.78 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.91 
 
 		 916 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  29.51 
 
 		 334 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  26.62 
 
 		 231 aa  42  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>