90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0221 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  47.5 
 
 
242 aa  222  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  47.77 
 
 
242 aa  214  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  45.83 
 
 
242 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  47.06 
 
 
240 aa  204  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  46.44 
 
 
241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  46.06 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  48.66 
 
 
242 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  40.59 
 
 
239 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  40.27 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  39.47 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  36.52 
 
 
244 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  34.91 
 
 
244 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  35.66 
 
 
964 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  36.89 
 
 
244 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  35.96 
 
 
244 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  34.93 
 
 
244 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  36.44 
 
 
244 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  37.28 
 
 
972 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
256 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  30.17 
 
 
977 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  35.39 
 
 
998 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
247 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.2 
 
 
240 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
235 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 
234 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.1 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  32.08 
 
 
891 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  29.95 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  36.75 
 
 
287 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  30.43 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  25.21 
 
 
770 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.49 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.36 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.18 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  28.51 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  25.9 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.44 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  27.08 
 
 
736 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  26.48 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 
371 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.38 
 
 
748 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.08 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
768 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.06 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
368 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  26.57 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  26.55 
 
 
927 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  30.16 
 
 
1106 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  25.86 
 
 
920 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.85 
 
 
767 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  28 
 
 
994 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.26 
 
 
916 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  26.88 
 
 
911 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  26.59 
 
 
921 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  26.63 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  31.82 
 
 
291 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
378 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.26 
 
 
916 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 
380 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 
371 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.85 
 
 
384 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.33 
 
 
371 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.26 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  27.46 
 
 
942 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
380 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
380 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
377 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  26.76 
 
 
936 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 
373 aa  42  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  27.01 
 
 
943 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
369 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  27.89 
 
 
930 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 
378 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 
373 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>