91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1769 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  48.68 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  42.01 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  40.35 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  37.77 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  40.09 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  39.82 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  36.56 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  40.83 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.89 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  37.45 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.72 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  35.42 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  37.94 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  34.42 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  38.05 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  41.81 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  36.73 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  31.09 
 
 		 244 aa  124  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  36.36 
 
 		 977 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  37.5 
 
 		 972 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  37.39 
 
 		 964 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  36.25 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  34.76 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  36.31 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  33.03 
 
 		 891 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  35.37 
 
 		 998 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  35.02 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  28.21 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  30.09 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  31.64 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.61 
 
 		 748 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  31.84 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.15 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.46 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  32.94 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  30.33 
 
 		 770 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 768 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.41 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.43 
 
 		 767 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  29.75 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.85 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  30.6 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 374 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  29.58 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  29.08 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  34.53 
 
 		 383 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  34.53 
 
 		 383 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  33.81 
 
 		 383 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  32.57 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  29.32 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.04 
 
 		 416 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  26.79 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  32.14 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  33.03 
 
 		 374 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  33.94 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  30.46 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  29.69 
 
 		 377 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 401 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  30.1 
 
 		 278 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 378 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 269 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  31.52 
 
 		 374 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  31.52 
 
 		 374 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 374 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  31.52 
 
 		 374 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.52 
 
 		 374 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.57 
 
 		 378 aa  42  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 374 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 374 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 376 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>