70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1946 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  100 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  47.08 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  42.56 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  42.8 
 
 		 240 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  41.22 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  40.74 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  40.59 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  35.54 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  35.39 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  35.8 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  34.98 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  34.17 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  32.66 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.88 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  33.89 
 
 		 964 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.91 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  36.64 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  35.32 
 
 		 972 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  31.05 
 
 		 998 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  32.11 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.92 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  31.6 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  31.43 
 
 		 977 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.53 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.91 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  32.84 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  27.53 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  27.03 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  26 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  26.34 
 
 		 891 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  31.94 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  27.49 
 
 		 770 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  32.04 
 
 		 748 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.12 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.31 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 768 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.57 
 
 		 736 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.06 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.13 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  27.08 
 
 		 911 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  30.26 
 
 		 922 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 930 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  28.48 
 
 		 927 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  25.65 
 
 		 916 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  31.9 
 
 		 929 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.53 
 
 		 916 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.9 
 
 		 914 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  26.71 
 
 		 994 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.46 
 
 		 907 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  24.84 
 
 		 922 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 384 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>