65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1754 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  32.81 
 
 
251 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  32.7 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  36.18 
 
 
254 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  35.52 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  29.8 
 
 
235 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
242 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  32.42 
 
 
241 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  34.75 
 
 
244 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
261 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  36.55 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  34.71 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  30.62 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  29.04 
 
 
287 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  33.07 
 
 
248 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
242 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
256 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  33.59 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  37.94 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  33.59 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  32.69 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.88 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.21 
 
 
270 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  32.82 
 
 
242 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 
234 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.92 
 
 
247 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  30.8 
 
 
977 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  35.03 
 
 
260 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  32.52 
 
 
770 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  30.23 
 
 
964 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  30.86 
 
 
998 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  32.95 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  30.23 
 
 
972 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.26 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  28.57 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  31.13 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.02 
 
 
891 aa  82  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.9 
 
 
736 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  33.46 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.99 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.84 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
768 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.77 
 
 
767 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  33.05 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29.36 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.1 
 
 
748 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
368 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  24.29 
 
 
375 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 
377 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  27.13 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2228  hypothetical protein  25.95 
 
 
458 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>