67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  88.93 
 
 		 244 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  73.66 
 
 		 244 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  71.19 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  69.96 
 
 		 243 aa  344  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  70.37 
 
 		 244 aa  343  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  57.79 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  59.26 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  59.67 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  47.52 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  46.05 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  35.92 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  41.32 
 
 		 998 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  36.99 
 
 		 977 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  40.52 
 
 		 964 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  32.49 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  37.66 
 
 		 972 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  37.44 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  33.88 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  34.93 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.59 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  38.3 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  35.95 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.24 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.94 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  30.64 
 
 		 891 aa  98.6  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  28.96 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  31.43 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  22.89 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.85 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  31.02 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.87 
 
 		 748 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29.84 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  27.67 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.71 
 
 		 770 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.5 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.48 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  27.03 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 768 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  28 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.92 
 
 		 767 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.48 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.37 
 
 		 384 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 381 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.83 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  27.2 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.35 
 
 		 365 aa  41.6  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>