94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5379 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  100 
 
 		 998 aa  1990    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  40.75 
 
 		 972 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  36.84 
 
 		 977 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  38.52 
 
 		 964 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 		 244 aa  172  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  41.74 
 
 		 243 aa  171  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 244 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  40.33 
 
 		 244 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  41.98 
 
 		 244 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  40.74 
 
 		 244 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  41.32 
 
 		 244 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  39.92 
 
 		 244 aa  162  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  42.15 
 
 		 244 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  28.14 
 
 		 891 aa  157  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 256 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 241 aa  145  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  33.61 
 
 		 244 aa  143  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 		 242 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.66 
 
 		 247 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 247 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 244 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  33.2 
 
 		 242 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 235 aa  125  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 		 242 aa  125  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  35.39 
 
 		 240 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  29.97 
 
 		 287 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 235 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  27.61 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.15 
 
 		 240 aa  114  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.86 
 
 		 256 aa  112  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  26.36 
 
 		 235 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  30.83 
 
 		 736 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  37.79 
 
 		 240 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  27.12 
 
 		 248 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  30.24 
 
 		 239 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  37.89 
 
 		 234 aa  101  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 768 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2608  ABC-type uncharacterized transport system  20.48 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00018467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.54 
 
 		 748 aa  95.5  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.48 
 
 		 767 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 235 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  31.62 
 
 		 248 aa  92  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  35.86 
 
 		 242 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  23.71 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  29.21 
 
 		 260 aa  80.1  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.58 
 
 		 770 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  26.34 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  25.27 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  25.93 
 
 		 610 aa  72  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  24.94 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  27.89 
 
 		 251 aa  70.1  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  25.06 
 
 		 600 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.07 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.21 
 
 		 244 aa  67  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  24.65 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  25.8 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  23.83 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.95 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  26.38 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 261 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 261 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 260 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2907  hypothetical protein  37.74 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  27.02 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08361  GldG  22.7 
 
 		 557 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  23.46 
 
 		 622 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3236  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  21.68 
 
 		 559 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  33.96 
 
 		 626 aa  56.2  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  30.73 
 
 		 270 aa  55.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  21.33 
 
 		 566 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0779  hypothetical protein  18.35 
 
 		 502 aa  53.1  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  31.25 
 
 		 911 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  30.05 
 
 		 901 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  22.11 
 
 		 462 aa  49.3  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  21.94 
 
 		 561 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  31.13 
 
 		 547 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  31.33 
 
 		 921 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 366 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  21.54 
 
 		 580 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  26.18 
 
 		 703 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.55 
 
 		 481 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  25.45 
 
 		 250 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  26.54 
 
 		 930 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  28.11 
 
 		 994 aa  45.8  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2112  hypothetical protein  22.73 
 
 		 495 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  30.56 
 
 		 550 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 364 aa  45.1  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  23.53 
 
 		 294 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  20.55 
 
 		 555 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.06 
 
 		 916 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  30.86 
 
 		 630 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>