45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4389 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  48.8 
 
 
603 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  48.8 
 
 
603 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1399    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  46.54 
 
 
630 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  44.83 
 
 
547 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  44.52 
 
 
580 aa  354  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  44.04 
 
 
517 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  36.21 
 
 
504 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  32.81 
 
 
481 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  30.43 
 
 
462 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  28.88 
 
 
498 aa  165  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  30.16 
 
 
440 aa  162  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  30.73 
 
 
450 aa  154  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  31.54 
 
 
462 aa  151  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  29.06 
 
 
485 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  32.63 
 
 
439 aa  137  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  27.98 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  28.57 
 
 
542 aa  126  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  25.2 
 
 
566 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  23.75 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0089  hypothetical protein  26.95 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  26.46 
 
 
508 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.87 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0297  hypothetical protein  27.63 
 
 
475 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  23.06 
 
 
557 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2647  hypothetical protein  26.01 
 
 
437 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  22.99 
 
 
736 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  26.77 
 
 
600 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 
768 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  22.37 
 
 
561 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.32 
 
 
767 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  25.26 
 
 
646 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  22.96 
 
 
770 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.71 
 
 
2313 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  25.13 
 
 
523 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.23 
 
 
830 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  33.94 
 
 
489 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  37.4 
 
 
444 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  32.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  25.63 
 
 
998 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6079  ABC-type uncharacterized transport system  29.13 
 
 
674 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  27.36 
 
 
729 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
201 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  34.46 
 
 
1706 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  35.38 
 
 
625 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>