59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4232 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1258    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  66.9 
 
 
547 aa  588  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  45.91 
 
 
603 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  45.91 
 
 
603 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  41.13 
 
 
703 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  42.75 
 
 
580 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  48.92 
 
 
517 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  38.59 
 
 
504 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  32.23 
 
 
481 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  25.86 
 
 
498 aa  147  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  30 
 
 
462 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  29.66 
 
 
485 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  27.85 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  29.75 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  28.74 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  23.93 
 
 
542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  23.98 
 
 
450 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  26.05 
 
 
457 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  23.68 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.83 
 
 
830 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0297  hypothetical protein  28.14 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.43 
 
 
561 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  25.91 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  52.38 
 
 
916 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2647  hypothetical protein  22.06 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  20.04 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0089  hypothetical protein  24.47 
 
 
498 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6079  ABC-type uncharacterized transport system  34.33 
 
 
674 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  23.74 
 
 
508 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  42.4 
 
 
1706 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  43.64 
 
 
1646 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  24.66 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  56.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  40.94 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  38.85 
 
 
407 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
768 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  38.79 
 
 
1745 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  22.09 
 
 
767 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  23.87 
 
 
770 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  39.02 
 
 
2313 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03720  DNA-directed RNA polymerase ii largest subunit, putative  43.33 
 
 
1786 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 
846 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  41.57 
 
 
653 aa  51.2  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  45.95 
 
 
433 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  35.46 
 
 
501 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  23.34 
 
 
610 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  42.73 
 
 
453 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  24.81 
 
 
600 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  23.08 
 
 
646 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  40.83 
 
 
1218 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.27 
 
 
257 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  46.83 
 
 
625 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  65.91 
 
 
338 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.34 
 
 
551 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  42.42 
 
 
848 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3236  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  20 
 
 
559 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  40.65 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 
682 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  22.05 
 
 
614 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>