74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3052 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  100 
 
 		 767 aa  1576    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  42.93 
 
 		 768 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  40.59 
 
 		 748 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  39.2 
 
 		 736 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  23.76 
 
 		 462 aa  97.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.98 
 
 		 251 aa  96.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  29.48 
 
 		 998 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 235 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  25.27 
 
 		 964 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.77 
 
 		 256 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.08 
 
 		 240 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  22.02 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.53 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  24.82 
 
 		 972 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.89 
 
 		 248 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  25.2 
 
 		 244 aa  73.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.91 
 
 		 254 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  27.49 
 
 		 977 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  22.36 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  22.71 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  26.8 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  26.51 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 		 242 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  26.95 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 267 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 234 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  27.9 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  23.27 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  22.98 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  23.4 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 253 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  20.69 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 244 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  21.88 
 
 		 630 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 235 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  29.66 
 
 		 287 aa  55.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  26.85 
 
 		 244 aa  54.7  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  28.85 
 
 		 244 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  28.8 
 
 		 891 aa  54.3  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  26.67 
 
 		 244 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  22.83 
 
 		 250 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 242 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  26.15 
 
 		 242 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  26.82 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 242 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  26.82 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  21.21 
 
 		 504 aa  50.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  30.28 
 
 		 920 aa  48.5  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  24.44 
 
 		 235 aa  48.9  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 234 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  24.38 
 
 		 498 aa  47.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  23.9 
 
 		 239 aa  47.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.7 
 
 		 247 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.97 
 
 		 270 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  30.56 
 
 		 580 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  22.16 
 
 		 260 aa  47.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  26.5 
 
 		 240 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  26.72 
 
 		 473 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  29.76 
 
 		 911 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  30.81 
 
 		 240 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  21.57 
 
 		 517 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 244 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2647  hypothetical protein  20.58 
 
 		 437 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  26.11 
 
 		 270 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  21.02 
 
 		 248 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  26.74 
 
 		 481 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>