40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_5374 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  98.72 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  99.15 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  98.72 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  97.86 
 
 
234 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  97.86 
 
 
234 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  80.77 
 
 
234 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  79.49 
 
 
234 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5408  ABC transporter, permease protein, putative  50.21 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.298823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  46.38 
 
 
235 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  46.38 
 
 
235 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 
372 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  22.95 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  23.96 
 
 
943 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3597  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  23.33 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  22.46 
 
 
936 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  22.46 
 
 
936 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  27.34 
 
 
927 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  21.37 
 
 
276 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.5 
 
 
347 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  24.74 
 
 
916 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
358 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  26.23 
 
 
906 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  26.23 
 
 
906 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 
906 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.75 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.56 
 
 
273 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25.83 
 
 
922 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  18.44 
 
 
917 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 
1079 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  26.96 
 
 
1066 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  26.96 
 
 
1089 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 
1071 aa  42  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 
1071 aa  42  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 
1082 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 
375 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  25.64 
 
 
906 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>