50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3496 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.48 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  38.35 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  35.15 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  32.94 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  26.22 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  26.14 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  26.14 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  25.73 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  25.73 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  30.45 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 280 aa  45.4  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  31.93 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.93 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.73 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  27.39 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.63 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 285 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 269 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>