57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  47.78 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  40.51 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.84 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.39 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.8 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.39 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.8 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.39 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.59 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.11 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.78 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  22.73 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.02 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  30.06 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.9 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  27.59 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  26.98 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  21.33 
 
 		 246 aa  42  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>