38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1905 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  49.79 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  49.8 
 
 		 264 aa  197  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.71 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  36.36 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  25.34 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  25.34 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  25.34 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.89 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.89 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.72 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.61 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  22.22 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 280 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>