57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  38.11 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  34.6 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  26.63 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.13 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.13 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.13 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.13 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 272 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.93 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.51 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.78 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.91 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  22.42 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 368 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 368 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 306 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  34.59 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  25.75 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.18 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  19.85 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 336 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.33 
 
 		 258 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>