61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2608 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  100 
 
 
244 aa  471  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 
244 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 
266 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
265 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.75 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  30.86 
 
 
244 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
244 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  30.04 
 
 
244 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  30.04 
 
 
244 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
244 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  29.22 
 
 
244 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  29.22 
 
 
244 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
244 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 
271 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  27.11 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.18 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  20.43 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  20.43 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  27.83 
 
 
381 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.4 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  22.97 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.6 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  23.47 
 
 
381 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  27.97 
 
 
381 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 
381 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  26.96 
 
 
381 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  24.35 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  24.35 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.35 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.39 
 
 
146 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  32.35 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  23.14 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28 
 
 
281 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
306 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  32.43 
 
 
366 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>