47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.62 
 
 		 146 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  31.47 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.55 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.55 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.61 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.61 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22.31 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  30.26 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.07 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  26.01 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  27.16 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.35 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.43 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0761  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.94 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.71 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.04 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  35.9 
 
 		 268 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>