25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0761 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0761  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 462 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  30.77 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  31.75 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  38.71 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 470 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 470 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 388 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 446 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 413 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>