More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1390 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  88.53 
 
 
462 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  942    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  57.61 
 
 
466 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0795  histidine kinase  32.38 
 
 
494 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.782448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1559  ATP-binding region, ATPase-like  31.6 
 
 
469 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  31.58 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  31.43 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  26.84 
 
 
444 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.73 
 
 
683 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2634  ATPase domain-containing protein  26.02 
 
 
434 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.24 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  28.57 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  32.87 
 
 
686 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  31.16 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 
795 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
795 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
795 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
795 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  30.54 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  27.59 
 
 
223 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  26.94 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  29.49 
 
 
349 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  29.74 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  25.48 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.31 
 
 
710 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.31 
 
 
710 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  31.79 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
680 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  31.86 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
391 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  31.15 
 
 
529 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  26.21 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  25.08 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.63 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.65 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
775 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  24.49 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
801 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  27.68 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
594 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  30.04 
 
 
687 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  27.53 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  27.4 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2146  putative signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00275148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  27.57 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  28.43 
 
 
485 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  23.74 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  26.98 
 
 
1101 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  26.15 
 
 
518 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  24.01 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  30.89 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  26.57 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  24.11 
 
 
1093 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  25.59 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
682 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  26.91 
 
 
664 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  28.8 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  25.62 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
596 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
700 aa  73.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.85 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  23.86 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  27.51 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  26.11 
 
 
1226 aa  73.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
654 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  29.41 
 
 
799 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  26.25 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  24.75 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  25.38 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>