46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3448 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  517  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  58.36 
 
 		 266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  60 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  47.77 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  46.09 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  37.34 
 
 		 244 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  34.54 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  31.2 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.29 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.29 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.89 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.89 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.89 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.11 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  26.16 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  39.71 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.01 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.86 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.42 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  19.25 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  20.95 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  18.5 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  18.5 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 286 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>