99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1722 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  100 
 
 		 241 aa  454  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  41.81 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  40.36 
 
 		 271 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  30.17 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  30.17 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  30.17 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  37.17 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.76 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  36.77 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.15 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 258 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29.89 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.16 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.57 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  33 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.36 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.8 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.55 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.14 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.05 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.89 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 378 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 377 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.77 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.71 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 336 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 383 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 259 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 259 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 383 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 270 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.63 
 
 		 383 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 259 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 266 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.18 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>