74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2879 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  23.59 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0008  hypothetical protein  21.98 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  38.16 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  26.8 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  18.9 
 
 		 325 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  39.34 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.03 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.9 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  25.81 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.77 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.51 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.34 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.07 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.23 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.15 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.49 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.51 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.78 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  27.66 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.06 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.14 
 
 		 375 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>