201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5172  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0259  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  27.35 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  27.2 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  27.2 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  27.2 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  27.2 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.67 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  23.48 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  26.42 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  24.89 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  24.89 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  21.98 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  23.44 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.05 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  25.84 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  22.43 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  23.13 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  25.73 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  23.94 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  22.62 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  22.99 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  24.11 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  23.86 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  25.52 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  22.5 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.21 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  22.92 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.5 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  22.32 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  22.35 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  22.32 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  22.79 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  24.24 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  19.79 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.36 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  26.24 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>