126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0259 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0259  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 277 aa  534  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5172  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  27.98 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.77 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  27.22 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.52 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  24.77 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.34 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.91 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.49 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  25.44 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  26.64 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  23.59 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.42 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  25.73 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  23.44 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.82 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.98 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.79 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.44 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.44 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.3 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.3 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  22.73 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.29 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  23.11 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 256 aa  45.8  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  22.07 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  27.66 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  24.85 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  21.55 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  28.27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  22.32 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  22.75 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.71 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  25.2 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.21 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>