271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0030 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  81.68 
 
 		 286 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  80.75 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  80.75 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  72.12 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  69.08 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  70.7 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  72.12 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  67.79 
 
 		 281 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  69.14 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 297 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  74.69 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  67.68 
 
 		 263 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  66.54 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  66.79 
 
 		 267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  66.79 
 
 		 277 aa  328  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  64.37 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  63.81 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  63.42 
 
 		 263 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  63.18 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  54.96 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  60.68 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  59.6 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  60.26 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  63.28 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  55.81 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  52.92 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  52.08 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  49.81 
 
 		 272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  52.34 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  50.38 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  34.05 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  32.74 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.8 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.26 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.92 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.45 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.48 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.48 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.4 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.05 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.52 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  26.85 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  30.9 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  24.36 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.67 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.68 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.51 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.81 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.35 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.24 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  27.13 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  32.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  32.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  32.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  32.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  32.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  32.16 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  32.16 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  32.16 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>